平戸は日本に初めてキリスト教を伝えたフランシスコ・ザビエルが三度布教に訪れた地である。その後、江戸時代の禁教令下でも隠れキリシタンとして信仰を受継いでいった人が多かった。平戸市街の丘にたつ現在の教会堂は1931年に建立された。